水晶种类繁多、颜色丰富，一般常见的是按颜色、包裹体分类的，如果按照其晶体性质的话，大致可分三类：显晶类，隐晶类，特别类。
下面我们就来了解三类水晶各自的特点：
显晶类：平时我们观赏的到由多条六角形水晶（六方晶系)生成一簇的水晶簇便是属于显晶类，而白水晶簇则是出现频率最高的一种，所以白水晶便可归于此类。此外紫水晶、黄水晶、粉晶、发晶、虎眼石等皆属此类。
隐晶类：水晶外观是一块块的，不是成六角水晶族状，但它们却也是属六方晶系的。但我们不能以向眼观察到它们的六角形结晶，因为结晶的体积极为细小，需以显微镜协助才能看到六角形结晶。此类水晶非常平滑，因为结晶之间有“水化枝石”填补。玛瑙便属于此类。
特别类：这类水晶和一般水晶分别很大，难以归为显晶类或隐晶类，所以归纳为特别类，例如结晶古怪嶙峋的骨干水晶、水晶内有山水星像图案的幻影水晶等皆归纳为此类。
