蓝宝石的肉眼鉴别包括天然品、处理品及合成品等鉴别方面分述如下：
(1)天然品鉴别，蓝宝石透明度较好，颜色不均一，但十分柔和。宝石颜色二色性强，其密度大，个头也较大。有星光效应的宝石星光线粗细不一，交汇处不完美。晶体中常见有呈平行六方柱面排列的且深浅不一的平直色带和生长纹，也见有呈百叶窗式出现的双晶纹。
不同产地蓝宝石鉴别特征：
印度克什米尔蓝宝石，颜色呈矢车菊的蓝色，即带紫的靛蓝色。颜色明亮、鲜艳，有雾状的包体。产地海拔高达5000多米，产量少，最近几年由于各种原因，几乎没有产量。
缅甸蓝宝石，颜色呈靛蓝色、蓝色，颜色鲜艳不均一，可见平直色带，颜色多色性明显，可见平直排列的百叶窗式双晶纹。常见呈架状分布的金红石包体，也常见有由金红石包体构成三组交角呈60。或120。的面网出现的星光蓝宝石。也含有被称为指纹状的弥漫型气液包裹体。常见的固体包体有刚玉、尖晶石、铀烧绿石、檐石、磷灰石等矿物小晶体，这些矿物呈圆滑状分布。
斯里兰卡蓝宝石，颜色浅，呈蓝到天蓝色。颜色明亮，可见平直色带。包体呈丝绢状、纤细状分布，常见呈六射星光出现的星光蓝宝石。也见有指纹状的液态包体。晶体中分布的固体包体有错石、磷灰石、黑云母等矿物，但包体数量少。
泰国蓝宝石，颜色呈带黑的蓝色、浅灰蓝色。晶体中指纹状液态包体发育。在黑色固态包体周围有呈荷叶状分布的裂纹。
澳大利亚蓝宝石，颜色呈碳黑的深蓝色、黄色、绿色等，含尘埃状包体。
中国蓝宝石，产自山东的蓝宝石个头大，颜色呈碳黑色的靛蓝色、蓝色、绿色和黄色，包体少，平直色带发育。产自黑龙江的蓝宝石颜色鲜艳，呈透明的蓝色、浅蓝色、灰蓝色、 浅绿色等，包体少，但个头小。产自海南岛的蓝宝石，颜色美丽而透明，包体少，缺陷少。大晶体中裂隙发育，有蚕籽状金红石包体分布。
(2)处理品鉴别，蓝宝石处理品包括扩散蓝宝石和充填蓝宝石。其鉴别特征如下：扩散蓝宝石，宝石颜色呈不规则的蛛网状、网格状、斑纹状分布;宝石棱角处、裂隙处颜色深，其他地方颜色浅，颜色浮在表面上，无色根。 充填蓝宝石，宝石中常有气泡分布，沿充填缝有彩虹效应出现。
(3)合成品鉴别，蓝宝石的合成方法不同，鉴别特征也不同。其鉴别标志如下：焰熔法合成蓝宝石，宝石颜色太均一，过分艳丽。内部干净，块体大，可见弧形生长纹，有气泡分布。台面有强的二色性，星光过分完美，星线清楚，细而均一。
助熔剂法合成蓝宝石，宝石中有云雾状的乳白色包体，包体常呈褐黄色或黑色的网状出现于晶体中。
(4)蓝宝石与相似蓝色宝石的区别，即主要膺品鉴别：
蓝色尖晶石，颜色均一，无二色性，晶体常见有八面体小包体。
蓝锆石，颜色鲜艳，强色散，可见棱刻面重影。
蓝碧玺，颜色蓝中带绿，有空管状气液包体，可见棱刻面重影，二色性强。 蓝锥矿，强二色性，强色散，可见棱刻面重影。
坦桑石，颜色有三色性，深蓝、紫红、黄绿色，密度小，硬度低。
人造蓝色尖晶石，颜色艳丽均一，在日光下呈红色调的蓝色。
